《寄宿日记》是一部温馨治愈的日常系漫画。大学生李安因为学校宿舍装修，暂时寄宿在一位远房亲戚的家里。这家的女主人温柔贤惠，但她的儿子——一个沉默寡言的高中生，对李安却充满敌意。在同住一个屋檐下的日子里，李安用他的真诚和乐观，一点点地融化了这个家庭因多年缺失父亲角色而筑起的冰墙，三人之间渐渐形成了如同家人般温暖的关系。
李安偷偷准备了圣诞树和礼物，想在异乡过个温暖的节日。当高中生第一次收到礼物时，他别扭地说着“幼稚”，却紧紧攥着礼物，不愿撒手。
李安尝试做便当，结果惨不忍睹。女主人手把手教他，高中生嘴上嫌弃，却把李安做的失败品吃得一干二净，别扭的关心让李安心里一暖。
李安在整理衣柜时，不小心翻出了高中生珍藏的棒球手套，那是他父亲留下的唯一遗物。两人为此大吵一架，李安也第一次知道了这个家庭的往事。
女主人深夜下班回家，看到李安和儿子正在客厅为了争论谁洗碗而进行一场幼稚的石头剪刀布大战，这充满生活气息的一幕让她忍不住笑了出来。
学校老师误以为李安是高中生的“不良哥哥”而叫家长，女主人赶到后，却坚定地维护了李安，称他是“我们家非常重要的一员”，让李安深受感动。
李安拎着行李，忐忑不安地按响了门铃。开门的是一位温柔的女性，但她身后的少年却用充满戒备和敌意的眼神瞪着他，这就是寄宿生活的开始。